百合于定植后的第2年立秋前后，待植株地上茎叶完全枯萎，地下鳞茎完全成熟时采收。南方一般8～9月为采收适期。这时采收的鳞茎不仅产量高、质量好，而且耐储藏。采收时尽可能选晴天（雨天和雨后采收，鳞茎易腐烂）。采收后去除泥土，切除地上部分和须根，将大鳞茎和小鳞茎分开，大鳞茎加工成商品，小鳞茎留作种用，并及时储藏在阴凉通风的地方。一般每亩可收鲜鳞茎800～1500公斤，折合干品350公斤。
　　剥片。一般用手剥，也可用刀在鳞茎基部横切一刀，使鳞茎分离，然后按外、中、内层分别洗净沥干盛装。如果混在一起，因鳞片的老嫩、厚薄不一，在泡片时难以掌握时间，会影响商品的质量。
　　泡片。水沸腾后，将洗净沥干的鳞片分类下锅。每100公斤水可放入鳞片20～30公斤，以鳞片不出水面为度。下锅后，要用棍棒轻轻搅拌数圈，这样能促使锅中鳞片受热均匀。泡片时火力要均匀，泡片时间为锅中水重新沸腾后5（小片）～10分钟（大片），即煮至鳞片边缘柔软，背面有极小的裂缝时迅速捞出，放入清水中漂洗净粘液，稍沥干。每锅水一般可泡片2～3次。若见锅内开水混浊，应换新水烧开后再泡，以免影响百合的色泽和质量。
　　晒片。选择卫生、无污染的场地和工具晾晒。晾晒时将漂洗后的鳞片轻轻薄摊在晒簟上，扒开使其分布均匀，未干时不要随意翻动，经两天后，当鳞片6成干时，再行翻晒，可减少破碎。晚上收进屋内摊晾，切勿重叠。遇阴天可用文火烤干。
　　包装与储藏。百合片晒干后用竹篓或粗麻袋包装。应置于阴凉通风干燥处储藏。防止受潮和虫蛀。防虫时忌熏硫，因熏硫后内心硬化，影响质量。